События сериала происходят после Saber Marionette J OVA и повествуют о новых приключениях Отару и его марионеток. На сей раз, Фауст вернулся, и снова пытается раскрыть секрет технологии Марионеток. Воины-марионетки вернулись, и разрываются между любовью к Отару и привязанностью к Фаусту; Сможет ли Отару, Лайм, Черри и Бладберри остановить Фауста в этот раз?