Рафаэла и её старшая сестра, Люсиэла, участвовали в эксперименте Организации. Эксперимент провалился, в результате чего Рафаэла потеряла свой глаз и покинула Организацию. После пробуждения Присциллы Организация предложила Рафаэле вернуться, и она стала 5-м номером в 78-м поколении, отыскивая и уничтожая клеймор, покинувших Организацию.